List of saddle points for conformational switches studied

> alpha_operon_saddle start energy: -37.100 saddle energy: -30.600 end energy: -33.700 barrier: 6.500
GUCUGUGCGUUUCCAUUUGAGUAUCCUGAAAACGGGCUUUUCAGCAUGGAACGUACAUAUUAAAUAGUAGGAGUGCAUAGUGGCCCGUAUAGCAGGCAUUAACAUUCCUGAUCAUAAGCAUGCCGUAAUC
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> amv_saddle start energy: -52.000 saddle energy: -46.200 end energy: -48.500 barrier: 5.800
AAUGCUGACCUCCACUGGGUGGAUUAAGGUCAAGGUAUGAAGUCCUAUUCGCUCCUGAUAGGAUCGACUUCAUAUUGCUUAUAUAUGUGCUAACGCACAUAUAUAAAUGCUCAUGCAAAACUGCAUGAAUGCCCCUAAGGGAUGC
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> Attenuator_saddle start energy: -21.600 saddle energy: -13.000 end energy: -20.400 barrier: 8.600
AUCCAGGAGGCUAGCGCGUGAGAAGAGAAACGGAAAACAGCGCCUGAAAGCCUCCCAGUGGAGGCUUUUUUUG
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> dsrA_saddle start energy: -32.300 saddle energy: -24.100 end energy: -29.800 barrier: 8.200
ACACAUCAGAUUUCCUGGUGUAACGAAUUUUUUAAGUGCUUCUUGCUUAAGCAAGUUUCAUCCCGACCCCCUCAGGGUCGGGAUU
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> hdv_saddle start energy: -70.100 saddle energy: -53.100 end energy: -69.600 barrier: 17.000
GGAAUGGCGGGACCCCACUCUGCAGGGUCCGCGUUCCAUCCUUUCUUACCUGAUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCACAAAUCUCUCUA
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> hiv_saddle start energy: -108.600 saddle energy: -97.300 end energy: -104.700 barrier: 11.300
GGUCUCUCUGGUUAGACCAGAUUUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCUAACUGGGAACCCACUGCUUAAGCCUCAAUAAAGCUUGCCUUGAGUGCUUCAAGUAGUGUGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUAACUAGAGAUCCCUCAGACCCUUUUAGUCAGUGUGGAAAAUCUCUAGCAGUGGCGCCCGAACAGGGACUUGAAAGCGAAAGGGAAACCAGAGGAGCUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGAAGCGCGCACGGCAAGAGGCGAGGGGA
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> ms2_saddle start energy: -32.700 saddle energy: -26.100 end energy: -27.300 barrier: 6.600
GGGUGGGACCCCUUUCGGGGUCCUGCUCAACUUCCUGUCGAGCUAAUGCCAUUUUUAAUGUCUUUAGCGAGAC
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> RB1_saddle start energy: -48.900 saddle energy: -24.860 end energy: -27.960 barrier: 24.040
CACUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGGUGAGCAAUGGAACCGCACGUGUACGGUUUUUUGUGAUAUCAGCAUUGCUUGCUCUUUAUUUGAGCGGGCAAUGCUUUUUUU
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> RB2_saddle start energy: -23.800 saddle energy: -16.550 end energy: -22.000 barrier: 7.250
GGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCGUAAACUCUUGAUUAUGAAGUCUGUCGCUUUAUCCGAAAUUUUAUAAAGAGAAGACUCAUGAAU
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> RB3_saddle start energy: -41.900 saddle energy: -24.000 end energy: -25.200 barrier: 17.900
CUCUUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGAUGAAACCCGGCAACCAGCCUUAGGGCAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGUUUCGCGUUGAAAGAUGAGAGAUUCUUGUAGUCUCUUCUUUUAGCGAAGGGACUUUUUUU
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> RB4_saddle start energy: -42.720 saddle energy: -25.820 end energy: -25.820 barrier: 16.900
GACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUCACGGACCACCAGGUCAUUGCUUCUUCACGUUAUGGCAGGAGCAAACUAUGCAAGUCGACCUGUGGUCC
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> RB5_saddle start energy: -49.400 saddle energy: -24.860 end energy: -27.960 barrier: 24.540
GGGAAUAUAAUAGGAACACUCAUAUAAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAAGUUUCUACCGGGCACCGUAAAUGUCCGACUAUGGGUGAGCAAUGGAACCGCACGUGUACGGUUUUUUGUGAUAUCAGCAUUGCUUGCUCUUUAUUUGAGCGGGCAAUGCUUUUUUUAUUCUCAUAACGGAGGUAGACAGGAUGGAUCCACUGA
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> ribD_saddle start energy: -100.220 saddle energy: -90.720 end energy: -93.720 barrier: 9.500
GGAAGGACAAAUGAAUAAAGAUUGUAUCCUUCGGGGCAGGGUGGAAAUCCCGACCGGCGGUAGUAAAGCACAUUUGCUUUAGAGCCCGUGACCCGUGUGCAUAAGCACGCGGUGGAUUCAGUUUAAGCUGAAGCCGACAGUGAAAGUCUGGAUGGGAGAAGGAUGAUGAGCCGCUAUGCAAAAUGUUUAAAAAUGCAUAGUGUUAUUUCCUAUUGCGUAAAAUACCUAAAGCCCCGAAUUUUUUAUAAAUUCGGGGCUUUUUUGACGGUAAAUAACAAAAGAGGGGAGGGAAACAAAUGGAAGA
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> S15_saddle start energy: -17.900 saddle energy: -11.300 end energy: -15.000 barrier: 6.600
CUGGGAUCGCUGAAUUAGAGAUCGGCGUCCUUUCAUUCUAUAUACUUUGGAGUUUUAAAAUGUCUCUAAGUACU
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> S-box_saddle start energy: -84.600 saddle energy: -79.400 end energy: -82.000 barrier: 5.200
AAAUGAUUCAACUUUUCAAAAAAUUAAUAACAUUUUCUCUUAUCGAGAGUUGGGCGAGGGAUUGGCCUUUUGACCCCAACAGCAACCGACCGUAAUACCAUUGUGAAAUGGGGCGCACUGCUUUUCGCGCCGAGACUGAUGUCUCAUAAGGCACGGUGCUAAUUCCAUCAGAUUGUGUCUGAGAGAUGAGAGAGGCAGUGUUUUACGUAGAAAAGCCUCUUUCUCUCAUGGGAAAGAGGCUUUUUGU
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> Spliced_leader_saddle start energy: -10.700 saddle energy: 2.200 end energy: -9.000 barrier: 12.900
AACUAAAACAAUUUUUGAAGAACAGUUUCUGUACUUCAUUGGUAUGUAGAGACUUC
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> thim_saddle start energy: -53.700 saddle energy: -38.860 end energy: -50.900 barrier: 14.840
GGAACCAAACGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAUACCCGUAUCACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGUAGGGAAGUCACGGACCACCAGGUCAUUGCUUCUUCACGUUAUGGCAGGAGCAAACUAUGCAAGUCGACCUGCUGGAUCCAGCGCAA
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